胡适在命名程甲本、程乙本的同时，指出程甲本“间有纰缪”，程乙本的“许多改订修正之处，胜于程甲本”。这些判断，宏观角度看是有道理的。
从微观角度看，值得关注的是，人们在翻刻程甲本的时候，是否完全忽视了程乙本？胡适在文中还提及“马幼渔先生所藏程甲本就是那‘初印’本”，据笔者考察，北京大学图书馆藏有马幼渔先生送给胡适的一部程甲本，扉页手书“东观阁原本，绣像红楼梦，本宅梓行”，在此程甲本上有多处贴改的文字，与东观阁木刻本相同，而且改文中，不乏与程乙本相同的文字。东观阁书坊在翻刻程甲本的过程中，同时参考了程乙本，也可以从这部书中找到较为重要的证据（曹立波《“东观阁原本”与程刻本的关系考辨》，《文学遗产》二〇〇三年第四期）。在对《红楼梦》木刻本的版本研究中，程乙本的影响因素也应给予考虑。
二、程乙本的改订工作在文学文献上的意义
程乙本对程甲本的改订，大致可从三个视角加以考察，即文学的、文献的，以及文学与文献兼顾的角度。
（一）文学角度：或更换词语，让骈偶句前后呼应；或调整木活字，以求得文通字顺；或对全文加以通盘考虑，瞻前顾后，有所取舍，以避免重复；或对小说情节矛盾加以斟酌，增订字句，以疏通文意。
例如第二十七回《葬花吟》“独把花锄泪暗洒”一句，程乙本将程甲本“泪暗洒”改作“偷洒泪”，从平仄角度看，由“仄仄平平仄仄仄”改为“仄仄平平平仄仄”，更合乎平仄规则。查其他抄本，甲戌本作“独倚花锄泪暗洒”，列藏本作“独把香锄泪暗洒”。庚辰、蒙府、戚序、舒序、甲辰等本为“独把花锄泪暗洒” ，与程甲本相同。诸抄本皆为“泪暗洒”，此处杨藏本底文作“泪暗洒”，改文作“偷洒泪”，与程乙本同。综上，程乙本此处的改动，或参考杨藏本，或属独创。又如第三十七回探春写给宝玉的书信，程甲本“忽思历来古人处名攻利敌之场”一句，“名攻利敌”程乙本作“名攻利夺”，己卯、庚辰、蒙府、戚序、舒序、列藏、甲辰等本同程甲本。杨藏本底文作“名攻敌”三字，改文作“名攻利夺”，同程乙本。程乙本将“敌”改为“夺”，名与利、攻与夺，词性对应更为紧密。
第九十四回贾母解释十一月海棠开花的原因时，程甲本作“应着小阳春的开花也天气因为和暖是有的，程乙本作“应着小阳春的天气因为和暖开花也是有的”。程甲本“开花也天气”，语句不通，显然属于活字排版的时候摆放不当所致。到程乙本中，把“天气因为和暖”六字，挪到“开花也”之前，成为：“应着小阳春的天气，因为和暖，开花也是有的。”这样一调整，句子就通顺了。
第八回写宝玉眼中的薛宝钗的一段文字，程乙本的改动较大。程甲本2b页9行至3a页3行：
宝玉掀帘一步进去，先就看见宝钗坐在炕上作针线，头上挽着黑漆油光的?儿，蜜合色棉袄，玫瑰紫二色金银鼠比肩褂，葱黄绫棉裙，一色半新不旧，看去不觉奢华。唇不点而红，眉不画而翠，脸若银盆，眼如水杏。罕言寡语，人谓装愚，安分随时，自云守拙。
程乙本2b页9行至3a页3行：
宝玉掀帘一步进去，先就看见宝钗坐在炕上作针线，头上挽着黑漆油光的?儿，蜜合色的棉袄，玫瑰紫二色金银线的坎肩儿，葱黄绫子棉裙，一色儿半新不旧，看去不见奢华，惟觉雅淡。罕言寡语，人谓装愚，安分随时，自云守拙。
因程甲本这里与第二十八回描写宝钗面庞眉眼的两段文字重复，程乙本将程甲本上的四句“唇不点而红，眉不画而翠，脸若银盆，眼如水杏”删掉。而在第二十八回，对程甲本上的四句，略作增改。程甲本为“脸若银盆，眼同水杏，唇不点而红，眉不画而翠”，程乙本前两句同程甲本，后两句改为“唇不点而含丹，眉不画而横翠”，与“红”“翠”相比，“含丹”“横翠”，虽增“含”和“横”两个字，却变为动宾结构。前两句为四字句，后两句改为六字句。词语和句式，与程甲本相比，都较为典雅。这是对全文加以通盘考虑，有所取舍，避免重复，以求文字精练。
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