宋真宗赵恒时（998－1022年），将“五龙祠”扩建为“五龙观”，赐额为“五龙灵应之观”。宣和年间（1119-1125）建紫霄宫。此外宋代还兴建佑圣观、王母宫、云霞观等。
元初，道士汪真常、鲁大宥、张守清等率徒众修复五龙、紫霄、南岩诸庙。元世祖于至元二十三年(1286年)将五龙观改为“五龙灵应宫”；延佑元年(1314年)赐额曰：“大天乙真庆万寿宫”。后大建元武(即真武)殿。元代碑文称“山列九宫八观，而五龙居先”。包括九宫(五龙、南岩、紫霄、太和、王母、紫虚、紫极、延长、天宫)；8观(佑圣、元和、云霞、威烈、回龙、仁威、太玄、三清)，还有许多较小观、庵、祠、庙等，据不完全统计有70多处。元末多毁于火，仅存“天乙真庆宫”石殿、古铜殿、琼台石殿之遗址。
明永乐年间，明成祖朱棣大修武当，永乐十年(1412年)道录司右正一孙碧云受命勘测设计遇真宫、紫霄宫、五龙宫、南岩宫。永乐十七年（1419年)隆平候张信、驸马都尉沐昕奉命创建紫云亭和紫金城。武当宫观，从永乐十年七月动工，主体工程于永乐十七年完成，附属工程于永乐二十一年完成。共建9宫9观33处建筑群，大小为楹1800多间。
包括玉虚、紫霄、五龙、南岩、净乐、太和、遇真、清微、朝天9宫，元和、回龙、太玄、复真、仁威、龙泉、威烈、八仙8观，以及五龙行宫，福地、老姥2殿，黑虎、关王2庙，榔梅仙翁祠、雷神洞和隐仙、灵虚、玉虚、仙侣、滴水、妙化、太子、崇福、灵应等9岩庙共33个大建筑群和39座桥梁，12亭及70余华里的石级登山栈道等。后清徽宫、朝天宫塌废，成化二年添建迎恩宫280间。
嘉靖三十一年（1552年），明世宗重修武当山宫观，太和、南岩、紫霄、五龙、玉虚、遇真、迎恩、净乐八大宫有房屋6266间。除将武当山原有庙观全部修缮外，另新修“治世玄岳”石牌坊一座。
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清乾隆后，大部分建筑毁于兵火。清末，武当山仅剩庙房3千多间。民国十五年九月，南岩宫被焚毁。朝天宫、文昌祠、斗姆阁、龙泉观等先后坍塌。及至1949年，武当山余庙房2千多间。1958年修建丹江口水库净乐宫、迎恩宫被淹。
1980—1990年，先后修复磨针井、复真观、泰山庙、回心庵、天津桥、南岩至金顶故道。同时对紫霄宫、太和宫、南岩宫等部分庙房进行修复，共计复原和重建207间，建筑面积29609平方米。修复3条古道，10座古石桥。2006年净乐宫复建。2012年玉虚宫复建。五龙宫和遇真宫还在修缮中。
武当山数百座道教建筑，分布在三条各长达近百公里的建筑线上，无论是建造在平川河边，还是建造在峰岭坡坨，全部都达到了同风水要求的完美统一，即使是人工进行了不少的加工，但是丝毫看不出人工雕琢的痕迹，给人一种虽为人造，却宛自天开的艺术之美的享受，不能不说是世界建筑史上的一个奇迹。
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