趣投稿|如何自动化、标准化捕获测序文库制备？

目标区域捕获测序技术，是根据已知特定基因组区域序列设计寡核苷酸探针，通过杂交将目标区域捕获富集进行二代测序。其针对目标区域深度测序，增加了检查灵敏度和准确性。既满足研究需求，又降低测序成本，在科研、临床中均备受关注。
液体处理专家贝克曼库尔特推出的Biomek自动化捕获测序方案，可帮助实现自动化、标准化的捕获测序。由自动化工作站进行基因捕获，可以减少手工操作时间，提高工作效率，增加结果的重复性和均一性。 Biomek工作站可实现从核酸提取，文库构建，定量混样到捕获的整体实验流程。

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【趣投稿|如何自动化、标准化捕获测序文库制备？】

图1. 捕获测序文库构建自动化流程。
由Biomek成功自动化的杂交捕获试剂盒

Agilent HaloPlex? Target Enrichment - Ion Torrent
Agilent SureSelect XT?
Epicentre ScriptSeq? Complete Gold Low Input
Illumina Nextera? Rapid Capture
Illumina TruSeq? Exome
Illumina TruSeq? Rapid Exome
Illumina TruSight? Cancer
Illumina TruSight? Tumor 15
Illumina TruSight? Tumor 170
IDT xGen? Exome Research Panel
NEB NEBNext Direct? Cancer HotSpot Panel
Roche Nimblegen SeqCap EZ? for Illumina NGS

Biomek自动化捕获测序数据展示

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图2. IDT xGen? Exome Research Panel试剂盒捕获测序文库制备。上图：片段分析，其中主峰1和2为杂交捕获后cfDNA目标片段峰；下图：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量结果。

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图3. IDT xGen? 杂交捕获试剂盒历史手工数据vs. Biomek i7自动化工作站完成数据。 A. 平均中靶率， B. 重复率， C. 覆盖度， D. GC偏移。
Biomek向导式软件操作界面
在软件操作界面上，用户可以选择样本数量，是否使用台面整合的PCR仪，以及运行工作流程的哪个部分。此外，具备台面自动校对功能，当操作人员完成耗材摆放后，工作站可根据摄像头拍摄，自动判定耗材摆放是否正确，对错误摆放位置进行提示。避免由于人为摆放耗材错误，导致设备碰撞或试剂、时间损失。