技术编程|碱基编辑器效果好不好 机器学习模型能预测
本文转自【科技日报】；
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【技术编程|碱基编辑器效果好不好 机器学习模型能预测】虽然碱基编辑器被广泛用于对基因进行定点编辑 ， 但至今为止 ， 我们对于碱基编辑器编辑效果的决定因素有哪些并不十分了解 。 美国哈佛大学刘如谦团队利用11个最受欢迎的碱基编辑器 ， 对哺乳动物细胞中约3.8万个基因位点进行编辑的数据 ， 创建了能精准预测碱基编辑器基因编辑效果的机器学习模型BE-Hive 。 研究人员发现 ， 通过对3388个疾病相关单核苷酸突变的编辑的验证 ， 发现BE-Hive预测准确率高达90%以上 ， 甚至能准确预测出哪些等位基因不会被编辑 。 研究人员还利用BE-Hive模型 ， 发现了某些碱基编辑器的“怪癖”——比如之前一般是将碱基C（胞嘧啶）变为T（胸腺嘧啶）的常规路线 ， 有时会将碱基C变为G（鸟嘌呤）或A（腺嘌呤） ， 从而帮助未来设计全新的碱基编辑工具 ， 改进碱基编辑器的基因编辑能力 。
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