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「禽流感」美国国家科学院院刊：绘制病毒“社交网络圈”或有效预测禽流感( 二 )


掌握流感病毒“社交网络圈”
通过对H5N1、H5N6、H7N9三个亚型的分析 ， 研究者发现野生鸟类迁徙网络只与H5N1在中国的传播有关 ， 而与其他两个亚型无关；通过中国家禽贸易网络可以预测禽流感病毒从一个地方传播到另一个地方的风险 ， 尤其是H7N9和H5N6亚型 。
研究团队将我国的“活禽贸易圈”通过网络聚类算法划分出来 ， 确定了五个“活禽贸易圈” ， 我国禽流感病毒的传播受到活禽贸易的影响 ， 可以分为5个区域 ， 它们在空间上对应于中国南部、东部、东北部、中北部和西部 。
“相同颜色的省份代表了同一个群体 ， 也代表了它们之间的活禽贸易更密切 。 ”田怀玉解释 ， “在每个区域内的活禽贸易和病毒传播比起区域之间都更为频繁 。 ”
「禽流感」美国国家科学院院刊：绘制病毒“社交网络圈”或有效预测禽流感
本文插图
通过H5N1、H5N6、H7N9亚型禽流感病毒HA基因序列推断出各省份间病毒传播和进化历史后 ， 发现活禽贸易的这个区域性结构也能很好地解释病毒在全国范围的传播规律 。 更进一步的定量分析发现 ， 在相同的活禽贸易群体内 ， 病毒的平均传播速率要高于不同贸易区域间的传播速率 。
“也就是说 ， 我们可以猜测在某一个省份发生的家禽禽流感暴发 ， 通过活禽贸易更有可能首先传播到同一贸易群体的地区 。 ”田怀玉说 。
3个亚型病毒的“黑历史”
通过海量数据的总结、分析和溯源 ， 可以厘清3个亚型病毒的“黑历史”：H5N1亚型最初在中国南部变成酶型 ， 随后主要传播到中国东南部和中国中北部 。 在H7N9和H5N6中观察到了相似的社区结构循环模式 。 H7N9病毒起源于中国东南部 ， 分为长江三角洲谱系和珠江三角洲谱系 ， 并在长三角、珠三角地区传播了三年多后 ， 引起了第1至第4次流行潮 ， 在第5次的流行中 ， 发现H7N9已从珠三角地区传播到中国所有其他区域 。 对于H5N6 ， 目前看还保持在长三角、珠三角地区区域性的循环传播中 。
「禽流感」美国国家科学院院刊：绘制病毒“社交网络圈”或有效预测禽流感
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该研究由北京师范大学、中国疾病预防控制中心国家流感中心、鲁汶大学、加州大学洛杉矶分校、中国科学院、山东第一医科大学、华南农业大学、中国林业科学研究院全国鸟类环志中心、奥斯陆大学、牛津大学等国内外研究团队一同合作完成 。
论文链接：
https://www.pnas.org/content/early/2020/02/25/1906954117
来源：科技日报
编辑：李俊霞
审核：管晶晶
【「禽流感」美国国家科学院院刊：绘制病毒“社交网络圈”或有效预测禽流感】终审：冷文生


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