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国际病毒分类委员会:新冠正式命名为SARS-Cov-2 ..( 三 )

国际病毒分类委员会:新冠正式命名为SARS-Cov-2 ..

与SARS-CoV相比 ， SARS-CoV-2的名称并非源自SARS疾病的名称（图5B） ， 并且绝不应该使用它来预先定义由人类SARS-CoV-2引起的疾病名称（或谱图） ， 这将由WHO决定 。 SARS-CoV-2的可用流行病学和临床数据有限 ， 表明该病毒和SARS-CoV的疾病谱以及传播方式可能不同 。 同样 ， 用于确认SARS-CoV-2感染的诊断方法与SARSCoV的诊断方法也不相同 。 这反映在针SARS-CoV-2 / 2019-nCoV的针对公共卫生从业者 ， 医护人员和实验室诊断人员的具体建议中（例如WHO 2019-nCoV指南； https：//www.who.int/emergencies/diseases /novel coronavirus2019） 。 通过取消冠状病毒及其可能在人类和动物中引起的疾病的命名约定 ， 我们希望以最适当的方式帮助WHO命名疾病（WHO疾病命名指南；https://apps.who.int/iris/handle/10665/163636）（图5B） 。 为了促进良好实践和科学交流 ， CSG建议研究人员描述该病毒和该物种中其他病毒的新分离株时 ， 应采用标准化格式存储公共数据库和出版物 。 提议的命名约定包括对从中分离出病毒的宿主生物的引用 ， 分离的时间以及分离的位置（地理位置）：病毒/分离物/宿主/日期/位置 ， 例如SARS CoV2 / X1 /Human/ 2019 /Wuhan_XYZ12345 。 完整的命名以及其他重要特征（例如与人或其他宿主的致病性相关）应包括在每个分离基因组序列提交给公共数据库 ， 例如基因库 。 在出版物中 ， 该名称可以用序列数据库ID进一步扩展 ， 例如 。 文字中首次提及的SARSCoV-2 / X1 /Human/ 2019 /Wuhan_XYZ12345 ， 我们相信 ， 这种格式将告知每个特定病毒分离株（基因组序列）的主要特征 ， 这些特征对于随后的流行病学和其他研究以及控制措施至关重要 。 结束语：从关注病原体到了解病毒种类从历史上看 ， 公共卫生和基础研究一直专注于对人类致病病毒的检测 ， 遏制 ， 治疗和分析 ， 而很少考虑探索和定义其作为一个物种的遗传多样性和生物学特性 。 在此框架下 ， 2019年12月SARS-CoV-2作为人类病原体的出现可能被认为完全独立于2002-2003年的SARS-CoV爆发 。 尽管SARS-CoV-2并非SARS-CoV的后代（图2B） ， 并且未知的外部因素可能会促进将这些病毒中的每一种引入人类 ， 但两种病毒在遗传上如此接近（图2B2C）他们的进化历史和特征是相互借鉴的 。 如果将这两种病毒与其他已知且尚待发现的病毒一起作为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒物种的一部分来鉴定 ， 我们对这些病原体的理解将大大提高 。 理解该物种的生物学和进化 ， 就像生物学中其他地方的规范一样 。 为了将这一发展与医疗保健联系起来 ， 针对整个物种的诊断工具应补充检测单个病原体变异的现有工具 。 尽管本文仅关注单个病毒物种 ， 但提出的问题涉及该科中其他物种 ， 甚至可能超出范围 。 作为了解此物种及其近亲的第一步 ， 研究人员 ， 期刊 ， 数据库和其他相关机构应适当引用正在研究的冠状病毒的完整分类法 。 这包括通过遵循ICTV命名规则明确承认相关病毒物种以及该物种中包含的病毒 ， 遗憾的是 ， 在常规实践中很少见到这种规则 ， 从而导致在文献中混淆病毒和物种（并且本文的作者希望承认 ， 他们在某些情况下也无法幸免） 。 ICTV目前正在讨论并计划在不久的将来实施病毒种类命名法的重大修订 ， 从而可以促进这种必要的调整 。 有了此更改 ， 解决CSG的问题就解决了病毒和物种名称之间现有的重大重叠 ， 而后者使得对其应用于冠状病毒的物种概念的理解和使用变得复杂 。 http://news.163.com/20/0212/13/F56JA25V00019NGP.html


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