高福院士论文：中国肺炎患者的新冠病毒( 二 )

图1.中国武汉最早的425个新型冠状病毒（2019-nCoV）感染肺炎（NCIP）确诊病例的发病情况。　　1月8日之后的发病率下降可能是由于诊断时间和实验室确诊时间的延迟。中国CDC代表中国疾病预防控制中心、NHC代表中华人民共和国国家卫生健康委员会， PCR代表聚合酶链反应， WHC代表武汉市卫生健康委员会， WHO代表世界卫生组织。　　患者的中位年龄为59岁（范围， 15~89岁）， 425例患者中有240例（56%）为男性。没有任何病例是15岁以下儿童。我们分析了三个时间段的病例特征：第一个时间段是1月1日（关闭华南海鲜批发市场的日期）前发病的患者；第二阶段是1月1日至1月11日（向武汉提供RT-PCR试剂的日期）期间发病的患者；第3个时间段是1月12日或之后发病的患者（表1）。发病较早的患者年龄略轻，男性比例较高，报告华南海鲜批发市场暴露史的比例明显较高。医务人员在病例中所占的比例在三个时间段逐步增加（表1）。　　表1.截至2020年1月22日时武汉新型冠状病毒感染肺炎患者的特征。 *

* 分母减小表示有缺失数据。因为舍入，百分比总计可能不是100 。　　我们分析了10例确诊病例的暴露数据，估计平均潜伏期为5.2天（95%置信区间[CI] ， 4.1~7.0）；分布情况的第95百分位数为12.5天（95% CI ， 9.2~18）（图2A）。我们获得了5个病例集群的信息，见图3 。根据这些集群中6对病例的发病日期，我们估计由一人传至另一人的平均（±SD）间隔时间分布情况为7.5±3.4天（95% CI ， 5.3~19）（图2B）。　　在截至2020年1月4日的流行曲线中，传染病增长率为每天0.10（95% CI ， 0.050~0.16），倍增时间为7.4天（95% CI ， 4.2~14）。应用上述由一人传至另一人的间隔时间分布情况，我们估计R0为2.2（95% CI ， 1.4~3.9）。　　在1月1日之前发病的45例患者中，从发病至首次就诊的平均间隔期估计为5.8天（95% CI ， 4.3~7.5），与1月1日至1月11日期间发病的207例患者的数据相似，后者的平均间隔期为4.6天（95% CI ， 4.1~5.1）（图2C）。在1月1日之前发病的44例患者中，从发病至住院的平均间隔期估计为12.5天（95% CI ， 10.3到~14.8），这一间隔期超过1月1日至1月11日期间发病的189例患者（均值， 9.1天； 95% CI ， 8.6~9.7）（图2D）。我们未绘制1月12日或之后发病患者的分布曲线，因为近期发病和发病与就诊之间的间隔期较长的患者尚未检测出。讨论　　我们在本文中报告了对NCIP传播动力学和流行病学特征所做的初步评估。尽管最早的病例大多数与华南海鲜批发市场相关，且患者的感染原因可能是发生人畜共患病或环境暴露，但如今显然已发生人际传播，而且疫情在最近几周逐渐加剧。我们的结果为下一步分析提供了重要参数，包括评估疾病控制措施的效果和预测感染未来的传播情况。

　　图2.事件发生的关键时间的分布情况　　潜伏期（即从感染至发病的时间）的估计分布情况见图A 。由一人传至另一人的间隔时间（即传播链中连续病例的发病时间间隔期）的估计分布情况见图B 。从发病至首次就诊的间隔时间的估计分布情况见图C 。从发病至住院的间隔时间的估计分布情况见图D 。　　我们估计R0约为2.2 ，这意味着每例患者平均将感染传给了另外2.2人。一般而言，只要R0大于1 ，疫情就会不断加剧，而疾病控制措施的目标是将再生数降低至1以下。 SARS12的R0估计为3 ，我们通过隔离患者和严格控制感染的方式成功控制了SARS疫情13 。控制NCIP疫情是面临的挑战包括明显存在许多轻度感染14 ，以及可用于隔离病例和隔离观察密切接触者的资源有限。我们对R0的估计仅限于1月4日之前，因为近几周以来人们对疫情认识的增加及检测试剂盒供应和使用的增多将增加得到确认的感染比例。武汉随后采取的控制措施，以及近期中国其他地区和国外采取的控制措施有可能已经降低了传播率，但中国其他地区和全球检出病例数量的增多提示疫情规模继续扩大。武汉及周边城市从1月23日以来采取的封城措施应该可以减少病例向中国其他地区和国外的输出，而目前的当务之急是确定其他地区是否也发生了类似强度的本地传播。

　　图3. 5个病例集群（包括16例病例）的详细暴露信息和发病日期。　　方框内的数字是2019年12月和2020年1月的日期。我们采用5个继发病例（明确只暴露于1个指示病例，并且无其他潜在传染源的患者）的数据估算了由一人传至另一人的间隔时间的分布情况。前4个病例集群是在武汉发现，第5个病例集群是在黄冈发现。　　值得关注的是，早期病例中儿童极少， 425个病例中有近一半的年龄≥60岁，但我们的病例定义中规定病情严重到需要医疗，而病情可能因是否有并发症而存在差异。此外，儿童可能不易受到感染，而且即使感染，其症状也较轻，上述两种情况均可解释确诊病例中儿童比例较低的情况。第一波疫情后的血清学调查将阐明这一问题。已经有医务人员发生感染，其比例低于SARS和MERS疫情时的情况15 。 SARS和MERS疫情时的特征之一是传播力的异质性，特别是超级传播的发生情况，其中尤其是医院发生的超级传播16 。尚未发现NCIP出现超级传播，但随着疫情的发展，有可能出现这一情况。　　尽管发病与就诊之间的间隔期一般较短，有27%的患者在发病后2天内就诊，但发病与住院之间的间隔期却要长得多，有89%的患者至少要到发病第5日才住院（图2）。这表明在疾病早期很难识别和隔离病例。为了积极主动追查病例，可能有必要在门诊和急诊科投入大量资源检测患者，这既是在尚未发生本地传播的地区所采取的疾病遏制策略，也是为了更早地对病例采取临床治疗。该方法还将提供关于亚临床感染的重要信息，以便更好地评估严重程度。　　我们对潜伏期分布情况所做的初步估计为暴露人群的14天医学观察期或隔离观察期提供了重要支持证据。我们的估计是基于10个病例的信息，结果不是很精确；进一步研究如果能提供关于该分布情况的更多信息，将具有重要意义。获得更多关于NCIP流行病学特征的数据之后，与SARS和MERS相应特征的详细比较，以及人类中4种冠状病毒的详细比较将为我们提供更多信息。　　本研究存在对新型病原体感染，尤其是在早期阶段进行初步研究时都面临的局限性，此时对疫情的各个方面都知之甚少，而且缺乏诊断试剂。为了提高早期检测和诊断的灵敏度，我们在识别病例时考虑了流行病学史，并随着信息的增多不断做出修订。武汉于1月11日获得PCR诊断试剂之后，病例的识别变得容易，这个有助于缩短病例确诊所需时间。此外，病例检测中最初关注的是肺炎患者，但现在我们知晓一些患者可能表现为胃肠道症状，也有一名儿童发生无症状感染的报道17 。临床表现不典型的早期感染可能被漏诊，而在确诊病例中，轻度感染可能未得到充分确认18 。我们未获得可纳入此项分析的详细疾病严重程度信息。总之，我们发现武汉现阶段的NCIP病例倍增时间约为7.4天。密切接触者之间的人际传播从12月中旬开始已经发生，并在此后一个月内逐渐播散。接下来的紧急工作包括确定可减少社区内传播的最有效控制措施。随着我们对流行病学特征和疫情动力学的了解不断增多，目前采用的病例定义可能需要作出修订。我们应继续监测病例特征，从而发现流行病学变化，例如在较小年龄人群或医务人员中发生的感染增多。未来的研究可以包括流行动力学的预测，以及对家庭内或其他地区人际传播情况开展的研究，此外用于确定亚临床感染发病率的血清学调查也将很有意义14 。这些初步推断是在包含每例确诊病例详细个人信息的“行列表”的基础上做出，但病例数量可能快速增多，这一监测方法将不再适用，我们可能需要采用其他方法19 。本文作者Qun Li, M.Med., Xuhua Guan, Ph.D., Peng Wu, Ph.D., Xiaoye Wang, M.P.H., Lei Zhou, M.Med., Yeqing Tong, Ph.D., Ruiqi Ren, M.Med., Kathy S.M. Leung, Ph.D., Eric H.Y. Lau, Ph.D., Jessica Y. Wong, Ph.D., Xuesen Xing, Ph.D., Nijuan Xiang, M.Med., Yang Wu, M.Sc., Chao Li, M.P.H., Qi Chen, M.Sc., Dan Li, M.P.H., Tian Liu, B.Med., Jing Zhao, M.Sc., Man Li, M.Sc., Wenxiao Tu, M.Med., Chuding Chen, M.Sc., Lianmei Jin, M.Med., Rui Yang, M.Med., Qi Wang, M.P.H., Suhua Zhou, M.Med., Rui Wang, M.D., Hui Liu, M.Med., Yingbo Luo, M.Sc., Yuan Liu, M.Med., Ge Shao, B.Med., Huan Li, M.P.H., Zhongfa Tao, M.P.H., Yang Yang, M.Med., Zhiqiang Deng, M.Med., Boxi Liu, M.P.H., Zhitao Ma, M.Med., Yanping Zhang, M.Med., Guoqing Shi, M.P.H., Tommy T.Y. Lam, Ph.D., Joseph T.K. Wu, Ph.D., George F. Gao, D.Phil., Benjamin J. Cowling, Ph.D., Bo Yang, M.Sc., Gabriel M. Leung, M.D., and Zijian Feng, M.Med.参考文献1. The 2019-nCoV Outbreak Joint Field Epidemiology Investigation Team, Li Q. Notes from the field: an outbreak of NCIP (2019-nCoV) infection in China — Wuhan, Hubei Province, 2019–2020. China CDC Weekly 2020;2:79-80.2. Tan WJ, Zhao X, Ma XJ, et al. 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