|新冠D614G突变席卷全球:感染力超2.6倍,与毒性无关( 三 )


【|新冠D614G突变席卷全球:感染力超2.6倍,与毒性无关】|新冠D614G突变席卷全球:感染力超2.6倍,与毒性无关
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由这4个基因突变组成的单倍型现在是全球的主要形式 。 在3月1日之前 , 在全球997个序列中发现了10%;3月1日至3月31日 , 14951个序列中发现了67%;4月1日至5月18日 , 12194个序列中发现了78% 。这就意味着 , 在一个月的时间内 , 携带D614G S蛋白突变的毒株成为SARS-CoV-2的全球主导形式 。 论文指出 , 从D614到G614的转变首先发生欧洲 , 随后发生在是北美和大洋洲 , 然后是亚洲 。研究指出 , 最早的携带D614G GISAID G分支4突变单倍型部分特征的序列是于1月下旬在中国和德国发现的 , 它们携带了定义该分支的4个突变中的3个 , 仅缺少RdRp P323L替换 。 研究团队分析 , 这可能是G支的祖先形式 。 其中一个早期武汉序列和一个泰国早期序列出现了D614G突变 , 而没有发生其他3个突变;这些可能是独立产生的 。研究团队最早检测到的携带所有4个突变的序列于2月20日在意大利采集 。 几天之内 , 这个单倍型在欧洲许多国家取样获得 。
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研究团队还从结构层面进行了研究 。 D614位于S蛋白原聚体的表面 , 可以与邻近的原聚体接触 。 研究援引此前的低温冷冻电镜结构指出 , 相邻的原聚体D614和T859的侧链形成了一个与原聚体之间的氢键 , 将一个原聚体的S1结构域的残基和另一个原聚体的S2结构域的残基结合在一起 。而突变为G614将消除这个侧链氢键 , 可能增加主链的灵活性和改变原聚体之间的相互作用 。 此外 , 这种替换可以调节附近N616位点的糖基化 , 影响邻近原聚体近端空间融合肽的动态 , 或者还将产生其他影响 。D614G和疾病严重程度之间没有显著关联 研究团队还研究了英格兰谢菲尔德地区999名COVID-19患者的临床数据 , 以此分析突变对疾病严重程度的影响 。
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他们发现 , 相比突变前 , 更高的病毒载量提示 , D614G突变病毒和患者上呼吸道病毒核酸水平较高相关 。 但论文同时指出 , “我们发现D614G和疾病严重程度之间没有显著关联 。 ”D614G与住院关联比较无统计学意义(p=0.66) , 尽管与ICU有临界意义(p=0.047) 。 回归分析也进一步证实了G614与更高的住院水平无关 。
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不过 , 研究团队提出 , G614突变假病毒与较高的传染性有关 。 研究量化分析得出 , 携带G614突变的病毒比对应的D614具有明显更高的感染性滴度 , 增加2.6至9.3倍 , 并在多种细胞类型中证实 。
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研究团队还测试了如果发生D614G变异 , 是否同样会被多克隆抗体中和 。 研究利用了6名圣地亚哥居民(可能在3月初至3月中旬感染 , 当时D614和G614都在传播)的康复期血清 , 与携带D614假病毒相比 , 他们的血清对带有G614假病毒的中和作用相当或更好 。论文指出 , “虽然我们不知道这些人感染的是哪种病毒 , 但这些初步数据表明 , 尽管在细胞培养中适应性增强 , 但携带G614的病毒在本质上并不会更能抵抗恢复期血清的中和作用 。 ” 研究团队指出 , G614变异的高传染性可能是其迅速传播和持续的充分原因 , 但也应考虑其他因素 。


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