用BWA做SNP时候，出现fail to locate the index，咋解决建库失败了

建库失败了还差两个 .bwt .sa 文件换个大内存节点重新建库试试
■网友
谢邀，本人长于芯片，短于测序，爱莫能助，十分sorry……
■网友
hg19的index网上是有的，你可以直接下载
■网友
bwa index 人类基因组肯定会超过 130 iterations。所以重新 index 一下就可以了。
我有个问题, read length 有多长？Read length 超过 75 就推荐使用 bwa mem；现在用 bwa aln 的情况一般比较少。

■网友
BWA的毛病比较多，你试试bowtie吧……
■网友
使用bwa aln或bwa mem 命令进行比对前，用 bwa index reference.fasta 命令将参考序列建立索引，并将产生的5个索引文件放在同一个目录中。

■网友
【用BWA做SNP时候，出现fail to locate the index，咋解决】 我也碰到了相同的问题，请问你的问题解决了么？如果解决了，是用什么方法解决的？谢谢！

■网友
换个版本试试

用BWA做SNP时候，出现fail to locate the index，咋解决

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