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新冠病毒|多国发现新冠病毒变异毒株，意味着什么？

如果你是一个爱健康的人 ， 别犹豫 ， 赶紧关注浩哥吧 。
近段时间 ， 一直有新的新冠变异毒株被发现报道 ， 比如之前在马来西亚现有的新冠肺炎确诊病例中确认了4例D614G变异毒株（这一变异毒株传播速度可能比一般毒株快10倍） 。 其中引起比较大反响的是8月份在印度发现的73个毒株新变种 。 据央视新闻消息 ， 据印度报业托拉斯15日报道 ， 印度当地研究人员在东部奥里萨邦发现了73个新冠病毒的新型变种 。 该研究团队的首席研究员达斯博士（Dr. Jayashankar Das）表示 ， 研究团队对包括752个临床样本在内的1536个样本进行了测序 ， 最终首次在印度报告了两个新的病毒谱系 。 报道称 ， 研究团队发现了73个新冠病毒毒株的新变种 。 达斯还补充说 ， 了解新冠病毒的详细特征对于治愈新冠肺炎患者很有帮助 。 这项研究将有助于了解新冠毒株的脆弱性 ， 以及印度东部 ， 尤其是奥里萨邦的病毒变异动态 。
那对于病毒频繁产生变异的现象 ， 很多朋友可能只是一味的感到恐惧 ， 对此 ， 我们又该如何理解和应对呢？这篇文章 ， 浩哥就来科普一下这个问题 。
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「病毒变异罕见吗？」
其实所谓变异 ， 本质上就是基因序列出现的变化 ， 不仅仅是病毒 ， 即便是我们人类 ， 无时无刻也都有细胞发生着序列变化（只不过绝大部分变异都是没有意义的 ， 随着细胞的自然凋亡就会消失 ， 只有极极极极少数的变异会对人体产生影响 ， 比如肿瘤的产生） 。 因此 ， 新冠变异并不奇怪 ， 本来就是RNA病毒 ， 加上目前感染数量已经如此巨大 ， 不变异才有鬼 。 但其实我们关注变异的本身 ， 是变异会对新的毒株带来怎样的表型变化（就是那些极少数产生作用的病毒序列变异 ， 比如毒性增强 ， 传播性增强等）？
对于印度发现的病毒变异 ， 我去查了下材料 ， 关于这个事件的原文报道 ， 目前能收到的只有两个媒体报道链接 ， 一个是the times of India, 一个是The new indian express 。
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浩哥接着去GISAID数据搜了下 ， 本来想查一下 ， 有没有这73个病毒毒株的序列数据 ， 无奈现在没有研究所邮箱了 ， 公司邮箱申请的账号还没过审 。 所以 ， 只有退而求其次 ， 去查了下GISAID上的新冠的流行病学传播工具 。 不巧 ， 即便数据库已经更新到十月份的数据了 ， 但印度的数据（下图的绿点）还集中在中部 ， 并没有奥里萨邦的数据（ODISHA ， 红色方框） ， 所以推测应该是还没有上传到数据库 。
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所以 ， 浩哥只能从媒体报道的内容里 ， 尝试寻找一些信息了 ， 当然也发现了一些亮点 。 首先 ， 我们看到 ， 媒体采访的印方研究所负责人说 ， 从这1536个样本中发现的新的新冠变异株系主要是B.112和B.199 。
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给大家简单说一下目前全球新冠毒株的谱系分类吧 ， 按GISAID上的官方描述 ， 目前全球的新冠病毒序列 ， 主要可分成六大分支（下图 ， S,L,V,G,GR,GH） ， 其中S,L,V株系是19年出现的（所以前边有19的数字） ， 而G,GR,GH三个株系是今年才出现的（名字有20的数字） ， 所以我们看到 ， 按印方负责人说的 ， 这次新发现的毒株是B.112和B.199株系 ， 那对应的就属于GR和GH的分支 。
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那这两个分支有什么特别的呢？从下图我们可以看到 ， 在已发现的病毒序列中 ， GH和GR都包含有S-D614G这种病毒型 。
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那D614G病毒型为什么如此‘臭名昭著’呢？
因为它是一个将新冠传染性带到一个新高度的变异型 ， 这种病毒型 ， 从今年2月份以来开始在全球爆发 ， 如今已经成为全球最常见的一种新冠病毒型[1][2][3][4] 。 而正是由于这种病毒型的突变 ， 改变了原病毒型（D614）的氨基酸序列 ， 将原来的614位天冬氨酸（缩写为D）变成了甘氨酸（缩写为G） ， 导致了这种病毒型的传染性进一步增强 。 这也是这种病毒型取名为D614G的原因 。
「病毒变异对我国防控的影响」
通过上文 ， 大家应该已经清楚了 ， 病毒的序列变异是非常正常的 ， 新型的毒株可能一直都在产生 ， 但大部分新型毒株其实并没有特别的表型表换 ， 所以大家其实不用过于恐慌 。 至于对于我国的防控工作 ， 浩哥觉得保持常规操作即可 ， 但从另一层面也需要密切关注这些新型病毒型后续的表型 ， 有没有特殊的变化 ， 另外边境的管控也要尤其注意 ， 毕竟最近云南瑞丽的疫情复发也是由于偷渡引起的 ， 虽然奥里萨邦离我们也不远 ， 但对其它国家的进出管控也更为关键 ， 因为貌似7月份 ， 美印就通航了......
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参考文献：
1. Tang, L.; Schulkins, A.; Chen, C.; Deshayes, K.; Kenney, J.S. The SARS-CoV-2 Spike Protein D614G Mutation Shows Increasing Dominance and May Confer a Structural Advantage to the Furin Cleavage Domain. Preprints 2020, 2020050407 (doi: 10.20944/preprints202005.0407.v1).
2.Maitra A , Sarkar M C , Raheja H , et al. Mutations in SARS-CoV-2 viral RNA identified in Eastern India: Possible implications for the ongoing outbreak in India and impact on viral structure and host susceptibility[J]. Journal of Bioences, 2020, 45(1)
3. The D614G mutation of SARS-CoV-2 spike protein enhances viral infectivity and decreases neutralization sensitivity to individual convalescent sera DO - 10.1101/2020.06.20.161323
【新冠病毒|多国发现新冠病毒变异毒株，意味着什么？】4. Koyama T , Weeraratne D , Snowdon J L , et al. Emergence of Drift Variants That May Affect COVID-19 Vaccine Development and Antibody Treatment[J]. Pathogens, 2020, 9(5):324.


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