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新冠病毒|日本出现变异新冠病毒并快速扩散是怎么回事？

我翻了半天的谷歌 ， 从the japan times找到了一些详细的报道 。
【新冠病毒|日本出现变异新冠病毒并快速扩散是怎么回事？】The National Institute of Infectious Diseases has said in a study that the coronavirus may have continued to spread unnoticed through carriers with mild or no symptoms after the outbreak from March to April receded once. The recently released study suggested that such a phenomenon may have led to the resurgence of COVID-19 infections in and after June, when Japan began resuming economic activities. In the study, which ran through July 16, the institute collected coronavirus samples from some 3,700 patients and analyzed the genome sequence. Because a virus undergoes mutations during the course of infection, the institute deduced how COVID-19 spread by looking at how the virus changed. The genome analysis found that the so-called European type of the virus spread widely in Japan in and after March but waned in late May thanks to preventive measures. In mid-June, however, an apparent variant of the European type was found in Tokyo that is believed to have emerged after more than three months of mutations. And a virus derived from that variant was later found in many other parts of Japan. As the institute did not find any virus that was in the midst of the mutation process, it pointed to the possibility that the coronavirus quietly spread among younger carriers, who tend to show no or little symptoms, and thus went unnoticed by public health centers. In the report, the institute noted that the coronavirus apparently could not be contained within Tokyo and eventually spread across the country, partly because people started making business trips after the economy reopened.
唔 ， 翻译过来概括就是
美国国家传染病研究所（NIH）在一项研究中表示 ， 在3月至4月爆发一次后 ， 冠状病毒可能继续通过有轻度或无症状的携带者继续传播 。
在这项持续到7月16日的研究中 ， 研究所收集了约3700名患者的冠状病毒样本 ， 并分析了基因组序列 。
由于病毒在感染过程中会发生突变 ， 因此该研究所通过研究病毒的变化来推论COVID-19的传播方式 。 基因组分析发现 ， 所谓的欧洲病毒在三月及之后在日本广泛传播 ， 但由于采取了预防措施 ， 于五月下旬逐渐减弱 。
然而 ， 在6月中旬 ， 在东京发现了一种明显的欧洲类型变体 ， 据信这种变体是在经过三个多月的突变后才出现的 。 后来在日本其他许多地方发现了源自该变种的病毒 。
别问我为啥日本的患者的基因测序是研究是美国NIH做的 ， 问就是国际主义 。
也就是说NIH监控了日本本土的病毒传播情况 ， 从3月到5月之间日本采用了很好的防御措施 ， 使得病毒传播得以控制 。
而从6与中旬采集到的病毒样本来看 ， 出现了新的变异类型 ， 根据NIH的推测这种变异是经过了3个月的传播的新突变类型 ， 而且已经在日本多地进行传播 ， 突破了日本的东京防卫圈 。
根据NIH分析的原因是：这种冠状病毒可能在年轻的携带者中悄悄传播 ， 这些携带者往往没有或几乎没有症状 ， 因此未被公共卫生中心所注意 。
也就是说这种新的突变会感染年轻人 ， 一无症状或者轻状的这种不易被人发现的情况下突破了卫生组织的检测得益传播 。
这个其实 ， 也满符合早先的推测的 ， 病毒总是在寻找新的传播方式以突破人类的围堵 ， 也就是毒性的降低和传播能力的增加这个方向 。 以前我也写过这方面的内容 。
在来说下日本本土的病毒传播型 。
从 the Nextstrain team利用GISAID的数据分析来看 ， 日本在3月传播的病毒是妥妥的20B ， 也就是我们说的欧洲方向的病毒 。 也就是这波病毒大部分都携带了传说中的D614G突变造成了传染能力的增强 。 红色的大圈圈代表日本的病例 。
新冠病毒|日本出现变异新冠病毒并快速扩散是怎么回事？
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把时间跨度拉到5月到7月之间 ， 也就是NIH报告发现病毒发生变异传播的部分的时候 。
新冠病毒|日本出现变异新冠病毒并快速扩散是怎么回事？
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大家可看我黄匡的部分 ， 确实跟3月份的有明显的不同 ， 虽然都还是20B的大分支之下 ， 但是与3月的主体并不相同 ， 是另一个进化分支的结果 。 来一个局部大图 。 也就是原来在日本本都传播最广的一个分支得到了有效的控制 。 而另一个突变增加了 。
新冠病毒|日本出现变异新冠病毒并快速扩散是怎么回事？
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概括下来就是NIH怀疑日本现在扩散的病毒在原有的20B欧洲型的基础之上又有了新突变 ， 会造成年轻人的无症状或者轻症状的感染以造成病毒的扩散性传播 。
所以是不是忽然觉得这个结论很眼熟？
没错 ， 美国从6月差不多就这个样子 。
而且从刚才几个红圈的序列信息来看 ， 接近这个序列分型的病毒 ， 在美国也非常的多 。 至于是谁传给谁的 ， 这就比较难说了 。
哦 ， 对了 ， 还有一个比较悲剧的消息 。
前边新发地疫情的时候提到过 ， 早些感染过最早一批的新冠病毒的同学可能无法免疫这种新的突变 。
嗯 ， 这叫来自中国的警告 。 这条警告不光是对中国有效 ， 对日本 ， 韩国以及东南亚很多地区同样有效 。 有一种雪上加霜的感觉 。
新冠病毒|日本出现变异新冠病毒并快速扩散是怎么回事？
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至于大家担心的疫苗是不是就又白开发了的情况 ， 以前就讨论过 ， 目前没有证据证明现有疫苗因突变导致失效 。 我们一直都担心病毒突发大型重组 ， 那就真的要从头开始了 。


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