2019新型冠状病毒 , 也被称为2019-nCoV , 2020年1月12日被世界卫生组织命名的新型病毒 。 研究表明2019-nCoV与2003年“非典”SARS冠状病毒和“中东呼吸综合征”MERS冠状病毒一样 , 同属于β属冠状病毒 。 通过基因序列比对 , 2019-nCoV与SARS-CoV有约80%相似性 , 与MERS-CoV有40%的相似性 。 从基于基因组序列构建的进化树来看 , 新型冠状病毒与普通感冒冠状病毒(绿色)关系并不接近 , 而是与SARS冠状病毒更为接近 。 可以看出冠状病毒进化树 , 红色:新型冠状病毒(BetaCoV);蓝色:SARS 冠状病毒(SARS-CoV);紫色:中东呼吸系统综合征冠状病毒(MERS-CoV) ;绿色:普通感冒冠状病毒 。
2019新型冠状病毒基因组大小29903个核苷酸 , 主要表达10个基因 , 其中表达的S蛋白(spike protein)是冠状病毒最重要的表面蛋白之一 , 与病毒的传染能力相关 。 S蛋白具有使病毒与宿主细胞膜受体结合及膜融合功能 , 决定了病毒的宿主范围和特异性;此外 , S蛋白可通过受体结合区的基因重组或突变实现不同宿主间传播 , 并导致较高致死率;同时 , S蛋白也是宿主中和抗体的重要作用位点 , 以及疫苗设计的关键靶点 。 虽然在基因组序列层面新型BetaCoV与SARS冠状病毒有些相似 , 但如下图所示 , 新型BetaCoV的S蛋白在表面表位以及受体结合域有很大不同!因此 , 新型病毒的传染性和严重性尚无法预测 。 此外 , 基于S蛋白设计的SARS-CoV候选疫苗对新型BetaCoV病毒或许也只有有限的交叉免疫反应 。 从图来看新型冠状病毒S蛋白与SARS的比较 。
值得注意的是 , 新型冠状病毒的主要蛋白酶(Main protease)与SARS之间高度保守 , 具有96%的总体同源性 , 是潜在的药物靶点;其中 , 基质与抑制剂的结合口袋部位与SARS是100%保守;因此 , 针对SARS-CoV主要蛋白酶开发的抑制剂或将具有与BetaCoV相似的结合潜力 。
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