太平洋电脑网:NVIDIA助力抗击疫情:开放GPU算力加速服务
【太平洋电脑网:NVIDIA助力抗击疫情:开放GPU算力加速服务】[PConline 资讯] 近日NVIDIA宣布 , 为了助力疫情控制 , Parabricks软件使用权将免费提供90天给全球所有新型冠状病毒研究人员 。 不过 , 只有使用NVIDIA GPU , 才能申请并获得Parabricks软件的使用权 。
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NVIDIA Parabricks软件基于著名的Genome Analysis Toolkit工具包 , 可通过GPU加速计算 , 将序列数据分析的速度提高50倍 。 在疫情依然严峻的当下 , 为了解新型病毒的传播方式以及感染方式 , 全球各地科研人员正在对新状病毒与感染者的基因组进行测序 , 但分析病毒需要花费大量的时间以及设备运算力 。
Parabricks团队在去年十二月加入了NVIDIA , 传统的分析基因技术需要几天时间 , 但使用Parabricks团队软件后可将时间缩短至一个小时以内 , 并且他们的软件可以在一台服务器上快速的运行 。
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NVIDIA这次的做法为应对目前严峻的疫情起到极大的帮助 , 提升运算力对了解病毒进化、疫苗开发带来巨大的推动作用 。 目前 , NVIDIA正积极联系服务供应商与计算中心 , 为Parabricks争取更多的计算资源 。
另外 , 使用Oxford Nanopore long-read数据的研究人员 , 可以GitHub上找到GPU加速工具存储库 , 目前 , Medaka、Raven、Racon、Unicycler 、Reticulatus已经内置了NVIDIA的Gpu加速服务 。
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