国内外有哪些开放/免费的生物信息云计算平台
古奥基因的还不错,我不是古奥基因的
可视化流程分析
■网友
我介绍一下国内的生物信息云计算平台 里面有一些平台的分析工具需要花虚拟币(很容易获得),非常耗资源的分析当然不是免费的了。
BGI online
BGIOnline 由华大基因推出,主要提供数据存储、传输、生物信息分析方法的开发和共享,比较适用于已经在玩生物信息的人。目前也上线了人外显子组和全基因组分析的标准流程,对于不懂编程的医学研究者,比较有用。
BMKCloud
BMKCloud是由北京百迈客生物科技有限公司历经5年开发,集成生物信息软件、数据库以及云计算、生物信息培训课程为一体的生物数据信息分析平台,不需要懂编程,可以一键式的完成生物信息分析,具有交互性、可视化的特点。
(1) 生信分析APP:可以进行转录组、非编码RNA,重测序、外显子等基本分析,基本是一键式的完成,可以选择一些分析的参数。
(2) 数据分析工具:有100多个,涵盖数据处理,文件操作,序列比对,基因注释和图表制作等;
(3) 数据库:这个平台还整合了已经发表的很多公共测序数据,生物信息分析的高手玩家可以整合这些数据和自己手上的数据,降低项目费用啊亲,这个真可以。
(4) 文献库:同步了NCBI的文献数据库,便于检索,也可以收藏到自己的文献库中,对于有测序数据的文献,竟然还可以一键导入APP中完成分析。
(5) 云课程:包括生物信息课程、云使用教程、高分文献解读讲解,是学习的网站,有理论,有操作,生物小白在这泡上几个月,那段位提高的不是一点半点呀。
这个就啰嗦这么多,主要是在这个平台上泡了几个月,比较有心得。
基云惠康
基云惠康是一家精准健康服务公司,主要围绕全基因组测序、解读、监测、应用开发以及专家指导等环节为个人提供最佳的健康管理解决方案。专注于人的外显子测序数据分析和全基因组测序数据分析服务。
聚道科技
聚道科技的GeneDock就是一家基因大数据云计算服务平台,。公司提供基因数据的传输、存储、分析、计算、协作和应用等一体化解决方案,将生物信息云服务化。同时提供开放的接口,让企业用户能够方便地来管理和操作数据,最后根据用户需求生产报告。GeneDock 的合作伙伴包括生物信息研发团队、科研机构、检测 / 测序服务商等。这些机构擅长通过测序所获得的信息来进行肿瘤诊断、遗传病风险评估、传染病源分析等。
GCBI
GCBI是一个面向基因芯片技术领域的开放服务平台。平台以基因样本+临床信息数据为核心,通过大数据分析、高性能运算及实时交互等多项技术,提供贯穿数据管理、分析挖掘、结果解读、成果转化、临床诊断的闭环服务,并在此基础上实现多元化商业模式。目前GCBI平台已经汇聚2700万篇SCI文献数据、132万份全基因样本数据及数十个全球主流的数据库,在肿瘤、慢性病、围术期医学、围产期医学等领域与众多科研机构共同推动多个临床辅助类服务产品开发,未来将在诊断试剂、新药测试及健康管理方向持续推动新产品研发。
总起来说,如果想实现转录组的分析,基本上就BMKcloud。
■网友
搜索omicshare云平台吧,里面都是都是真正免费的工具,已经被60多篇SCI引用了。你用了会回来感谢我的。
■网友
免费只能呵呵了。 你都知道是很耗资源的。。 可以试试genedock
■网友
免费的只知道galaxy,但是你确定受得了那个速度?DNAnexus和sevenbridge都不错,也不算贵。顺便打个广告,BGI ONLINE现在开始公测了,欢迎发email到service@genomics.cn 询问
■网友
我现在就在帮生工生物做云平台~~
■网友
目前个人认为国内的生物云平台更多的处于噱头和资本驱使,真正落到实用之处的少之又少,目前国内有华大、百迈克、烈冰(NovelBrain)等是专业做云平台的,华大是实力雄厚,实际应用比较少,百迈克是最近两年才开始做的,烈冰公司比较小,云平台经验丰富,是传统的生信公司转变的,目前免费的比较少,可以索取试用,希望对你有帮助
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