病例|10月27日31省区市新增确诊42例 北京新发地疫情病毒源头最新结论( 二 )
新发地市场聚集性疫情中的病例和环境样本中获得病毒基因组序列分析表明其病毒序列具有明显的突变特征 ， 和我国之前所发现的本土及输入病例均不相同 ， 揭示该次疫情应为单一性的境外输入 。
研究团队进一步利用自主开发的低病毒载量样品处理方法 ， 对110个病例和环境样本进行了高通量核酸测序 ， 共获得了72条高质量的新冠病毒基因组序列 。 分析发现 ， 这些序列均具有8个特征性突变位点 ， 这些位点在我国此前的本土和输入病例中从未发现过 。 与新冠病毒基因序列数据库比对 ， 发现除C6026T突变位点之外 ， 具有其它7个突变位点的病毒主要存在于欧洲 。 这些结果进一步提示本次疫情的病毒应为单一性的新发境外输入 。
文章图片
新发地疫情中的病例和环境样本中获得病毒基因组序列分析表明其病毒序列具有明显的突变特征 ， 和我国之前所发现的本土及输入病例均不相同 ， 揭示该次疫情应为单一性的境外输入 。
综合上述结果 ， 同时确认S14号摊位的工作人员未接触过疑似或确诊新冠病毒感染者 ， 且5月至6月初期北京也无报告新增感染病例 ， 提示病毒极可能来源于境外输入 。 进一步调查显示 ， S14号摊位售卖的物品中冰鲜三文鱼是唯一来自境外的商品 ， 且摊主曾于5月30日从某供应商处采买过从存在新冠病毒疫情国家进口、包装完整的三文鱼 ， 在市场内切割处理后零售 。 为此 ， 研究人员对新发地市场内所有三文鱼供应商的冷库进行了采样检测 ， 发现某供应商有5份鱼体拭子样本呈新冠病毒核酸阳性 ， 其中1份未开封鱼体拭子样本中测序获得的病毒基因组序列与本次疫情中人和环境样本中的病毒高度同源 。
因未能从鱼体上分离获得活病毒 ， 因此尚无法证明鱼体上的病毒活力 。 但是将高质量病毒基因组序列特征分析与流行病学调查结合 ， 提示来自境外疫情高发区的冷链进口食品极有可能为本次新发地市场聚集性疫情病毒源头 。 在文章发表过程中 ， 中国疾控中心报告从青岛获取的冷链食品中分离出新冠病毒 ， 进一步提示冷链食品可能是新冠病毒传播的重要途径 。 研究对于揭示北京新发地市场聚集性疫情的病毒来源提供了重要证据 ， 为优化疫情常态化防控策略提供了重要依据 。
研究中 ， 多家机构开展精诚合作 。 其中 ， 北京市疾病预防控制中心新冠病毒肺炎防控和检测组参与完成现场调查、样本采集和核酸筛查 。 中国医学科学院病原生物学研究所王健伟、任丽丽研究团队在P3实验室完成了样品的核酸测序前处理流程 。 清华大学王建斌课题组与北京大学黄岩谊课题组发展的快速基因组测序样品处理方法为本次疫情关键样品的准确快速病毒测序提供了技术基础和实验支持 。 中国科学院北京基因组研究所李明锟课题组完成了对关键样品序列的分析 。
北京市疾病预防控制中心主任医师庞星火、主管医师吴双胜 ， 中国医学科学院病原生物学研究所研究员任丽丽和中国科学院北京基因组研究所研究生马文泰为论文共同第一作者 。
图片来自清华大学结构生物学高精尖创新中心公众号
【病例|10月27日31省区市新增确诊42例 北京新发地疫情病毒源头最新结论】
推荐阅读
- 台军|坠毁事件16天后，台军F5复飞
- 美军|美军部队出现第9例新冠死亡病例 感染人数还在激增
- 病例|美多地爆发抗议冲突 单日增确诊超10万人！白宫被硝烟弥漫
- 钓鱼岛|美日军演剑指钓鱼岛？千万别被忽悠了
- 病例|美国将迎来最难熬冬天：疫情8天5次破纪录！医疗资源严重紧缺
- 巡台|解放军军机巡台强度继续增加：10月至少25天，再创新纪录
- 新冠|全美新冠确诊病例突破900万 没想到，特朗普说出了这话！
- 野猪|200斤大野猪冲进奶茶店！女店员的反应绝了
- 军事训练|武警安徽总队合肥支队组织军事训练
- 高科技|国防部：高科技改善高原官兵训练与生活条件