靶基因|重庆大学黄川课题组揭示ASO技术对靶基因转录活性的影响
反义寡核苷酸（Antisense oligonucleotide, ASO）是一种脱氧核苷酸类似物 ， 长度通常在15~20 nt ， 能够通过碱基互补配对与其靶标RNA结合 ， 并使得靶标RNA被RNaseH切割引发基因沉默 ， 进而降低或抑制靶标RNA的生物学功能 。 因此 ， 反义寡核苷酸技术既是分子生物学基因功能研究的重要工具 ， 又是生物医学疾病治疗方面的新星药物 。
尽管ASO技术发展迅速 ， 但关于“ASO是否在细胞核中影响靶基因的新生RNA转录延伸”这一问题却存在争议 。 近日 ， SCIENCE CHINA Life Sciences在线发表了重庆大学生命科学学院/前沿交叉学科研究院黄川课题组题为“Antisense oligonucleotide technology can be used to investigate a circular but not linear RNA-mediated function for its encoded gene locus”的研究论文 ， 阐述了ASO技术导致靶基因转录提前终止的机制及应用意义 。
【靶基因|重庆大学黄川课题组揭示ASO技术对靶基因转录活性的影响】
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该研究发现 ， 在果蝇S2细胞中 ， ASO转染会造成靶基因新生RNA表达量显著下降 ， 并且导致RNA聚合酶II的释放 ， 这表明ASO技术可能影响靶基因的转录活性 。 研究者进一步探究了该现象的分子机制 ， 并阐明Integrator ， Rat1 ， exosome在ASO诱导的转录提前终止中的重要作用 。 此外 ， 研究者还发现 ， 特异识别circRNA backsplicing junction位点的ASO并不会对于环状RNA的生成造成影响 。
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ASO技术对转录的影响
该论文阐述了ASO技术的局限性 ， 这为ASO技术在分子生物学基因功能研究和生物医学疾病治疗的应用提供指导意义 。 重庆大学生命科学学院/前沿交叉学科研究院硕士生宋振兴和博士生贾瑞瑞为论文第一作者 ， 黄川教授为通讯作者 。 研究得到了国家自然科学基金委、重庆市自然科学基金委、重庆市人社局、中央高校基金项目的资助 。
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