科技日报环状DNA测序工具面世，有望促进农业和癌症等领域的研究
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环状DNA测序工具面世有望促进农业和癌症等领域的研究(图片来源：物理学家组织网)
科技日报采访人员?刘霞
据物理学家组织网5月14日报道 ， 加拿大阿尔伯塔大学生物学家发明了一种新工具 ， 可对环状DNA进行测序 ， 这将为科学家提供更丰富、更准确的数据 ， 有望促进针对病毒、农业甚至癌症的研究 。
这一工具名为“CIDER-Seq” ， 它使用了被称为“PacBio”的DNA测序技术 ， 研究人员目前已将其发表在网络上 ， 供其他科学家分析DNA序列 。
研究主要作者、博士后研究员德文·梅塔说：“借助CIDER-Seq ， 我们可以了解神秘的环状DNA在人和植物细胞中的功能 。 ”
研究人员解释称 ， 环状DNA在细菌和病毒的基因组中很常见 ， 最近 ， 科学家又在人和植物细胞的核内发现了环状DNA ， 并将其称为染色体外环状DNA（eccDNA） 。 这种鲜为人知的环状DNA也常出现在癌细胞中 ， 甚至可能与其快速繁殖的能力有关 。
研究人员此前已开始着手调查eccDNA在癌症中的作用 ， 但由于缺乏有效的研究和测序方法 ， 此类研究进展缓慢 。
梅塔说：“鉴于此 ， 我们设计了一种新的分子生物学方法和新的生物信息学算法 ， 以最终获得eccDNA的完整序列 。 我们的方法能对这些分子进行完整测序 ， 并为我们和其他研究人员提供一种新工具 ， 可以更好地了解它们在细胞中的实际作用 。 ”
【科技日报环状DNA测序工具面世，有望促进农业和癌症等领域的研究】梅塔指出 ， 新工具可能对农业科学家特别有用 ， 因为许多农作物感染的病毒都拥有环状DNA 。 他举例说：“在肯尼亚的一次田间试验中 ， 我们使用CIDER-Seq的早期版本 ， 帮助研究了经过基因工程改造的农作物在对抗环状DNA病毒方面的有效性 。 ”
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