微生物@AI又当医生了,这次是通过血液识别癌症
AI又当医生了,这次是通过血液识别癌症
近日,顶尖学术期刊《自然》上线了一项有关癌症诊断的重要研究 。
与以往不同的是,来自美国加州大学圣迭戈分校的科学家,通过训练人工智能从血液中鉴定微生物的遗传物质,不仅可以识别出癌症,还能对不同类型的癌症做出区分 。
“这是一个很有前景的方向,改变了传统的检测方法,而且运用人工智能技术,使得海量的检索和比对工作得以快速而准确地完成 。”南京信息工程大学教授徐军评价道 。
【微生物@AI又当医生了,这次是通过血液识别癌症】微生物与肿瘤微环境息息相关
菌群与人体的关系毫无疑问是十分密切的 。有科学家估计,在每个人的身体中细菌的数量占到了人体所有活细胞的90% 。此外,我们体内还有许多病毒存在 。
这些常驻人体的微生物几乎参与了人体的一切生命活动,所以,它们的核酸片段(DNA或RNA)也就经血液游荡在我们体内 。
近年来,许多研究证据显示,人体微生物对多种类型的肿瘤有“贡献” 。科学家猜想,这些微生物在癌症中所起的作用也许比我们已知的更多 。因为以前的癌症研究工作,忽略了人体癌细胞与微生物可能有复杂的相互作用 。
这也就提供了一种全新的检测癌症的思路:用正常人血液中与癌症患者血液做对比,其中的微生物是否会有差别呢?
于是,美国加州大学圣迭戈分校的科学家有了一个大胆的设想:分析血液中来自微生物的遗传物质,可以根据其特征模式来识别体内的肿瘤 。
如果在过去,这种设想真的只能是想想罢了,“这是因为细菌的数量十分庞大,检测它们的基因序列将是一个海量工程 。”徐军说,但是得益于基因测序技术的发展,现在测序的费用与时间都在大幅下降,同时微生物的基因测序也能够运用AI技术,效率能大大提升 。
徐军告诉采访人员,疾病的检测、诊断和治疗是一个非常复杂的过程,需要借助多方面信息,比如图像数据、基因数据、分子和蛋白的表达,患者的病史、遗传背景、家族史等其他数据化信息,以及患者的临床数据,微生物的核酸特征等等 。大数据和机器学习技术的加入,从基因层面、细胞层面、以及微生物层面展现患者个体化的信息 。
“我们对这些问题理解越深刻,治疗疾病的成功率就越高 。”徐军说,在没有AI技术之前,尽管我们能够采集大量的数据,但是由于能力限制,能够获取的知识很有限 。比如尽管我们能够破译人类的基因,但是目前90%以上的信息我们还不能理解对疾病的诊断和治疗有什么作用 。
人工智能测癌可靠性有多高
研究人员在几千份样本中找到相应的微生物特征后,把工作交给了人工智能 。通过相应的机器学习模型来挖掘大量数据,把特定的微生物序列特征与特定的癌症相匹配 。
“机器学习的方式主要有监督学习和非监督学习,从这个项目公开的信息来看,采用的是监督学习模式 。”徐军分析说,监督学习的特点是人类会把知识传授给计算机,计算机根据样本的特征进行学习,接下来就能够自动区分疾病或者健康的样本 。
另一种非监督学习将能够使得机器具备更高的智能,即人类没有给计算机提示,计算机通过归纳的样本之间的规律和模式,突破了以往需人类干预才可学习的局限 。
“现在还有一种新的非监督学习模式——对抗学习,其特点是人类设计出两个模型,一个用于制造伪装数据,另一个用于鉴别伪装,在你来我往中实现互赢,最后达到纳什均衡状态 。”徐军认为,我国拥有大量的疾病数据,医学和人工智能领域之间如果能够长期深入合作,将能够更好地为患者服务 。
从此项研究的结果来看,这套AI模型在实际诊断中是可靠的 。科学家让AI对100名患者的样本血浆进行分析,并与69名健康无癌个体的血样进行比较 。机器学习模型不仅可以区分患癌和无癌的样本,还能区分不同类型的癌症:以86%的敏感性识别出肺癌患者,对于无肺部疾病的个体没有出现假阳性报告,并且以81%的准确率区分出前列腺癌和肺癌 。
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