研究还表明 ， 新冠病毒基因组没有发生重组事件 。 中新社昆明2月22日电 据中国科学院西双版纳热带植物园官方网站消息 ， 该园联合华南农业大学和北京脑科中心 ， 收集了全球共享到GISAID EpiFluTM数据库中覆盖四大洲12个国家的93个新冠病毒样本基因组数据(截至2月12日) ， 通过全基因组数据解析发现：武汉华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入 。
中国科学院西双版纳热带植物园官网截图 93个样本包含58种单倍型 ， 演化关系显示 ， 单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型 ， 通过一个中间载体(mv1 ， 可能是祖先单倍型 ， 也可能是来自中间宿主或“零号病人”)与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联 ， 并通过单倍型H3衍生出单倍型H1 。 研究人员称 ， 与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是H1及其衍生单倍型H2 ， H8-H12 ， 而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关 。 可见 ， 华南海鲜市场的新冠病毒是从其它地方传入 ， 再在市场发生快速传播并蔓延 。 另根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断 ， 也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论 。 此外 ， 研究人员对H13和H38的病毒样品溯源发现 ， 分别来自深圳的病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例) 。 他们的旅行记录表明都是2019年12月底至2020年1月初在武汉被感染 。 现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型 。 研究还显示 ， 新冠病毒在2月12日前发生过2次明显种群扩张：一次是2019年12月8日 ， 该结果暗示病毒可能在12月初 ， 甚至11月下旬已开始人际传播 ， 随后在华南海鲜市场加快；另一次种群扩张发生在1月6日 。 值得一提的是 ， 为细分来源 ， 研究人员将58种单倍型分成五组 ， 包括3个古老超级传播者单倍型(H1,H3和H13)和2个新的超级传播者单倍型(H56和mv2) 。 以此鉴别出广东的病毒可能有三个来源 ， 重庆和台湾的病毒有两个来源 。 有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国 ， 患者感染源至少有两个 ， 尤其是美国包括了五个来源 。 特别值得关注的是H56这个超级传播者单倍型 ， 同时是澳大利亚、法国和美国以及中国台湾患者的传染源
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