文/凤凰新闻客户端荣誉主笔 唐驳虎1月11日 , 中国向世界卫生组织和国际研究机构提交了武汉新冠肺炎的其中一位患者身上病毒的基因全测序信息 。 各国科学家随即展开了对基因的分析研究 , 也让其他有实力的国家也能较快地研制出PCR检测盒 。 中国科研人员也正在公开分享更多患者的病毒基因组全序列 , 目前已有53例患者的病毒基因组全序列被共享在全球共享的基因数据库 。
1月30日 , 国际著名医学杂志《柳叶刀》 , 发表论文《2019年新型冠状病毒的基因组表征和流行病学:对病毒起源和受体结合的影响》 。 作者来自中国疾控中心、山东大学、山东第一医科大学(山东医学科学院)、湖北疾控中心、华大基因、中国科学院、解放军总医院、温州医科大学、悉尼大学的研究人员 。 当然 , 由于基因序列都是公开的 , 所有正常的生物学家也都能得出同样的结论 。
病毒来自浙江舟山?在国际基因库里搜索 , 与nCoV病毒最紧密相关的冠状病毒是bat-SL-CoVZC45(同源性87.99%;查询覆盖率99%) , 以及病毒bat-SL-CoVZXC21(同源性87.23%;查询覆盖率98%) 。 这两种最接近的病毒 , 均由原南京军区军事医学研究所(现东部战区疾控中心) 分别于2015年、2017年在浙江舟山的蝙蝠身上捕获 , 并于2018年向国际基因库提交序列测序结果 。
但这能否就说明病毒来自浙江舟山?不 , 这差得太远了 。 nCoV病毒与浙江舟山采集到的病毒同源性不到88% , 而与SARS病毒的同源性也有79% 。 nCoV这一类冠状病毒 , 总共有近29000个核苷酸碱基 , 这些碱基保存着繁殖这种病毒的遗传指令 。 作为一种典型的RNA病毒 , 每个复制周期都会产生突变(复制出错) 。 根据SARS病毒和nCoV病毒的21%的差异程度 , 科学家们估算 , SARS病毒和nCoV病毒大约在25到65年前有一个共同的祖先 。 同样nCoV病毒与舟山采集的病毒样本多达12%的差异程度 , 也可以推算 , 大约12到35年前 , 这两种病毒就演化分异了 , 差的实在还是有点太远 。
再说 , 虽然SARS病毒最终追踪到了云南的山洞蝙蝠 , 但类似的病毒还分布在贵州、广西采集到的的蝙蝠身上 。 稍远的亲缘样本 , 还在分布在陕西、湖北乃至香港的蝙蝠身上 。 能够与2019年nCoV病毒高度同源的冠状病毒究竟来自哪里的蝙蝠 , 还需要作为“病毒捕手”的科学家们慢慢探源 。
SARS病毒的起源2003年的SARS病毒 , 虽然很快就被怀疑是由蝙蝠传染到了果子狸身上 , 再通过些许演化重组 , 传入人群当中 。 当年冬天 , 广东再度零星发现有人被SARS感染 , 钟南山等专家力主 , 扑杀所有养殖和售卖的果子狸 , 结束了这场风波 。
研究人员在中国各地的洞穴中捕捉蝙蝠 , 以采集它们的冠状病毒样本但这个推想用了近10年时间才逐一落实查证 。 科学家们最终在云南山洞的蝙蝠身上 , 找到了高度同源的SARS病毒起源地 。 最终得出结论:云南的蝙蝠(自然宿主)身上的冠状病毒 , 传染到了养殖场的果子狸(中间宿主)身上 , 最终通过酒店、野味市场员工 , 传入人群(最终宿主) 。 所以当1月1日证实汉口站边上的华南海鲜市场是新型冠状病毒的疫源地 , 同时该市场西区存在多处售卖野生动物的摊点 , 我也就立刻明白了这是怎么回事 。
nCoV病毒的细致分析
红色是SARS , 蓝色和紫色是两种舟山样本 。 这张图非常直观地展示了nCoV、SARS和两种舟山样本之间 , 具体每一段的基因差异性 。 顶部的绿色代表nCoV序列 , 下方曲线代表具体每一段序列 , SARS和两种舟山样本与nCoV的差异率 。 与两种舟山样本相比 , 大部分段落相似率在80%以上 , 局部段落在50%左右 。 但并不是全然不同 。 看到这张图 , 就会明白同源性和差异性都具体表现在哪里 。 而基因的人工操作和自然突变的特征本身是极为显著的 。 人工分子操作 , 最正常常规的是对序列的剪接 , 也就是剪下一段有特定功能的序列 , 然后连接到另一段序列之中 。 不然无从表达出这段功能 。 对单个碱基进行改变操作 , 并不是不可以 , 但却几乎没有实际上的意义 。 要想在A病毒身上体现B病毒的特性 , 就必须把这一小段有特定功能的序列(短片段)整个搬运过来 , 也就必然体现出与A病毒原始序列的巨大差别 。 ——而且这些功能片段都是非常容易被同行一眼看穿的 。
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